Choć kościół we wsi został wybudowany w latach 1936-1937, to starania o samodzielność parafialną rozpoczęto już na początku XX wieku. Kamień węgielny pod nową świątynię poświęcił ordynariusz diecezji tarnowskiej bp Franciszek Lisowski. On też w lipcu 1937 roku skierował do parafii św. Małgorzaty w Nowym Sączu jako wikariusza ks. Ewarysta Michalskiego z poleceniem prac wykończeniowych przy budowie kościoła i plebanii.
Dekretem z dnia 30 marca 1938 r. bp ordynariusz Franciszek Lisowski ustanawia parafię w Paszynie, wydzieloną z terytorium parafii św. Małgorzaty w Nowym Sączu., a pierwszym proboszczem mianuje wspomnianego ks. Ewarysta Michalskiego.
Patronką kościoła jest Matka Boża Nieustającej Pomocy, natomiast patronem parafii – św. Józef Robotnik.
Kościół został konsekrowany 27 czerwca 1963 roku przez ówczesnego ordynariusza diecezji bpa Jerzego Ablewicza.
Pieniądze na budowę świątyni uzyskano ze sprzedaży gruntów należących od XII wieku do kościoła Świętego Wojciecha, a które od 1448roku przypadały kolegiacie nowosądeckiej.
Wznoszenie kościoła rozpoczęto w 1936 roku, a projekt jego budowy wykonał mieszkający w Nowym Sączu absolwent oddziału architektury Politechniki we Lwowie, Zenon Remi. Polichromię głównego ołtarza zaprojektowała i wykonała sądecka malarka Maria Ritter, natomiast polichromię przedstawiającą „Gody w Kanie Galilejskiej” i „Wskrzeszenie młodzieńca z Naim” jest autorstwa Adama Walczyńskiego.
