Kościół został zbudowany przez czeskich luteran. W 1624 r. przejęli go karmelici i zamienili w pomnik zwycięstwa katolickich Habsburgów nad czeskimi protestantami. Rozegrana w 1620 r. wielka bitwa na Białej Górze, stała się największą klęską w historii Czech. Po zakończeniu bitwy, katoliccy Habsburgowie pościnali głowy czeskim przywódcom protestanckim oraz przekazali luterańskie kościoły katolikom, zmuszając przy tym większość mieszkańców Pragi do zmiany wyznania na katolicyzm.
Kościół jest sanktuarium, do którego wędrują pielgrzymki, pragnące zobaczyć Praskie Dzieciątko Jezus. Drewniana figurka pokryta woskiem została przywieziona z Hiszpanii w 1628 r. Cudowna laleczka przyozdobiona jest zmienianymi co jakiś czas, kosztownymi sukienkami. Napływające z całego świata prezenty dla Jezuska – jedwabne, satynowe, aksamitne, koronkowe sukienki ozdobione biżuterią - prezentowane są w małym muzeum przykościelnym.